南通支云前身是2014年成立的广西龙桂达，2015年12月31日，俱乐部变更工商注册，北迁江苏省南通市，并更名为南通支云足球俱乐部。2018年10月27日，在中国足球乙级联赛半决赛中，南通支云以总比分1-0击败陕西大秦之水，成功打进决赛，并成功升入中甲联赛。
球队主教练谢晖在球员职业生涯期间还曾经效力过多支德国乙级球队。2009年退役后他在上海申花担任助理教练兼新闻发言人。2017赛季开始，他在上海上港担任助理教练，辅佐新任主教练博阿斯。在2020年开始便担任南通支云的主教练。
球队前锋查加斯是球队中进球最多的球员，本赛季目前的16场联赛打进7球。
南通支云在本赛季首次与北京理工的比赛中取得了3-0的胜利，优势明显。
南通支云进攻能力不错，本赛季目前的16轮联赛打进28球，场均进球数达到1.75个。