南通支云前身是2014年成立的广西龙桂达。2015年底，俱乐部变更工商注册，北迁江苏南通，并更名为南通支云足球俱乐部。2018年球队拿到中乙亚军，升入中甲。上赛季球队名列中甲联赛第5名。
球队现任主帅为40岁的曹睿，球员时代一直效力于江苏队，退役后曾担任过江苏队的助理教练，先后辅佐崔龙洙、卡佩罗、奥拉罗尤等名帅，并随队拿到了2020赛季中超冠军。在上赛季中期，曹睿接替谢晖成为了南通支云主教练。
南通支云上一轮联赛3-0战胜黑龙江冰城，取得了最近5场联赛中的第3场胜利。
球队前锋科雷亚是球队中进球最多的球员，目前代表球队出场28场联赛打进17球。
球队阵中目前有多达13名球员在联赛中取得了进球，球队进攻点不算少。
南通支云进攻出色，目前的28场联赛打进53球，场均进球数接近2球。
南通支云防守做得也很好，目前的28场联赛仅仅丢了11球，场均丢球数不到1球。